¿ÞÂÊ ¸Þ´º ŸÀÌÆ² À̹ÌÁö
Áֿ伺°ú

Home < Áֿ伺°ú < Áֿ伺°ú

       Ç×»ýÁ¦ »ý»ê ÃÖÀûÈ­¸¦ À§ÇÑ ¹æ¼±±Õ À¯ÀüÀû µµ±¸ °³¹ß
               
       ISBC        2018.09.04 17:26        2950
 

Ç×»ýÁ¦ »ý»ê ÃÖÀûÈ­¸¦ À§ÇÑ ¹æ¼±±Õ À¯ÀüÀû µµ±¸ °³¹ß


Çѱ¹°úÇбâ¼ú¿ø Á¶º´°ü ±³¼ö


Yi JS, Kim MW, Kim M, Jeong Y, Kim EJ, Cho BK, Kim BG (2016). A novel approach for gene expression optimization through native promoter and 5¡¯ UTR combinations based on RNA-seq, Ribo-seq, and TSS-seq of Streptomyces coelicolor. ACS Synth. Biol. 2016 December DOI: 10.1021/acssynbio.6b00263


1. ¿¬±¸¹è°æ


¹æ¼±±ÕÀº ´Ù¾çÇÑ Ç×»ýÁ¦¸¦ »ý»êÇÏ´Â ¹Ì»ý¹° ±ÕÁÖ·Î, Áö±Ý±îÁö ¾Ë·ÁÁø ÀÚ¿¬ ¹ß»ý Ç×»ý¹°ÁúÀÇ 70% ÀÌ»óÀ» »ý»êÇÑ´Ù. ÀÌ Áß ÀÇÇС¤³ó¾÷ÀûÀ¸·Î À¯¿ëÇÑ Ç×»ýÁ¦ »ý»êÀ» Áõ°¡½Ã۱â À§ÇØ ¹æ¼±±Õ¿¡¼­ Ç×»ýÁ¦ »ýÇÕ¼º À¯ÀüÀÚ¿Í Á¶Àý ³×Æ®¿öÅ©¸¦ Á¶ÀÛÇÏ·Á´Â ½Ãµµ°¡ µÇ¾î ¿Ô´Âµ¥, ÀÌ °úÁ¤¿¡¼­ ¹æ¼±±Õ À¯Àüü¸¦ Á¶ÀÛÇÒ ¶§ »ç¿ëÇÒ ¼ö ÀÖ´Â À¯ÀüÀû µµ±¸°¡ ºÎÁ·ÇÏ´Ù´Â Á¡ÀÌ ÇѰè·Î ÀÛ¿ëÇϰí ÀÖ´Ù. À̸¦ ÇØ°áÇϱâ À§ÇØ ÃÖ±Ù¿¡´Â ¸¶ÀÌÅ©·Î¾î·¹À̳ª RNA ¿°±â¼­¿­ºÐ¼® °á°ú µî Àü»ç¹° ¹ßÇö¾çÀ» ±âÁØÀ¸·Î ¸î °³ÀÇ ÇÁ·Î¸ðÅͰ¡ °³¹ßµÇ¾ú´Ù. ±×·¯³ª ½ÇÁ¦·Î »ý»ê¹°ÀÇ ¾çÀº Àü»ç¹°ÀÇ ¹ßÇö·® »Ó¸¸ ¾Æ´Ï¶ó Àü»ç¹°ÀÌ ¹ø¿ªµÇ´Â È¿À²¿¡ ´õ Á÷Á¢ÀûÀ¸·Î ¿µÇâÀ» ¹Þ±â ¶§¹®¿¡ À¯ÀüÀû µµ±¸ °³¹ß ½Ã ¹ø¿ª È¿À² ¶ÇÇÑ °í·ÁÇØ¾ß ÇÒ Çʿ䰡 ÀÖ´Ù. ÃÖ±Ù ¸ðµ¨ ¹æ¼±±ÕÀÎ Streptomyces coelicolor¿¡¼­ ¿©·¯ Â÷¼¼´ë ¿°±â¼­¿­ºÐ¼®±â¼ú(Next-generation sequencing)À» ÀÌ¿ëÇÏ¿© À¯ÀüÀû ±¸Á¶ Á¤º¸¿Í Àü»ç ¹× ¹ø¿ª ¼öÁØ¿¡¼­ÀÇ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇöÀ» °üÂûÇÔÀ¸·Î½á, Àü»ç½ÃÀÛÁöÁ¡ÀÇ Á¤È®ÇÑ À§Ä¡¿Í Àü»ç¹° ¹ßÇö¾ç, ±×¸®°í ¹ø¿ª È¿À²À» Àüü À¯Àüü ¼öÁØ¿¡¼­ ¹àÈù ¿¬±¸ °á°ú°¡ ÀÖ´Ù.


2. ¿¬±¸³»¿ë


º» ¿¬±¸¿¡¼­´Â ¼¼ Á¾·ùÀÇ Â÷¼¼´ë ¿°±â¼­¿­ºÐ¼® ÀÀ¿ë±â¼ú(Àü»ç½ÃÀÛÁöÁ¡ ¿°±â¼­¿­ºÐ¼®, RNA ¿°±â¼­¿­ºÐ¼®, ¸®º¸¼Ø °áÇÕ RNA ¿°±â¼­¿­ºÐ¼®)À» S. coelicolor¿¡ Àû¿ëÇØ¼­ ¾òÀº Àüü À¯Àüü ¼öÁØÀÇ Á¤º¸¸¦ ÀÌ¿ëÇÏ¿©, Ç×»ýÁ¦ »ý»ê Áõ´ë¸¦ À§ÇÑ À¯ÀüÀÚ Á¶ÀÛ ½Ã ÀÌ¿ëÇÒ ¼ö ÀÖ´Â À¯ÀüÀû µµ±¸(ÇÁ·Î¸ðÅÍ, ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§)¸¦ ÇÕ¸®ÀûÀÎ µðÀÚÀÎÀ» ÅëÇØ °³¹ßÇÏ¿´´Ù.



±×¸² 1. ÇÕ¸®ÀûÀÎ µðÀÚÀÎÀ» ÅëÇÑ À¯ÀüÀû µµ±¸ °³¹ß °úÁ¤


Àü»ç¹° ¹ßÇö¾çÀº Àü»ç½ÃÀÛÁöÁ¡ÀÇ ¾Õ¿¡ Á¸ÀçÇÏ´Â ÇÁ·Î¸ðÅÍ ¼­¿­¿¡ ÀÇÇØ Á¶ÀýµÇ°í, ÀÌ Àü»ç¹°ÀÌ ¹ø¿ªµÇ´Â È¿À²Àº 5¡®ºñ¹ø¿ªºÎÀ§(untranslated region)¿¡ ÀÖ´Â ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§ ¼­¿­¿¡ ¿µÇâÀ» ¹Þ±â ¶§¹®¿¡, ´Ù¾çÇÑ Á¶°Ç¿¡¼­ Áö¼ÓÀûÀ¸·Î À¯ÀüÀÚ ¹ßÇöÀ» ƯÁ¤ ¼öÁØÀ¸·Î À¯ÁöÇÒ ¼ö ÀÖ´Â À¯ÀüÀû µµ±¸¸¦ ¼±Á¤Çϱâ À§ÇØ RNA ¿°±â¼­¿­ºÐ¼® °á°ú¿Í ¸®º¸¼Ø °áÇÕ RNA ¿°±â¼­¿­ºÐ¼® °á°ú·ÎºÎÅÍ ÇÁ·Î¸ðÅÍ¿Í ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§ È常¦ ¼±Á¤ÇÏ¿´´Ù.


±×¸² 2. ÇÁ·Î¸ðÅÍ ¹× ¸®º¸¼Ø °áÇÕ À§Ä¡ ¼±Á¤ °úÁ¤


¼±Á¤µÈ ÇÁ·Î¸ðÅÍ¿Í ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§·ÎºÎÅÍ ÃÖÁ¾ÀûÀ¸·Î ´Ù¾çÇÑ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö ¼öÁØÀ» °¡Áø 8°³ÀÇ Á¶ÇÕÀ» ¸¸µé¾ú°í, Àü»ç½ÃÀÛÁöÁ¡ ¿°±â¼­¿­ºÐ¼®À» ÅëÇØ ¾òÀº Á¤È®ÇÑ Àü»ç½ÃÀÛÁöÁ¡ Á¤º¸¸¦ ÀÌ¿ëÇÔÀ¸·Î½á ÇÁ·Î¸ðÅÍ¿Í 5¡®ºñ¹ø¿ªºÎÀ§ »çÀÌÀÇ °£¼·ÀÌ ÃÖ¼ÒÈ­ µÇ°Ô ÇÏ¿´´Ù. ÀÌ¿Í °°ÀÌ µðÀÚÀÎ ÇßÀ» ¶§, RNA ¿°±â¼­¿­ºÐ¼® °á°ú¿Í ¸®º¸¼Ø °áÇÕ RNA ¿°±â¼­¿­ºÐ¼® °á°ú·ÎºÎÅÍ °è»êµÈ ¹ßÇö ¼öÁذú ¸®Æ÷ÅÍ ½Ã½ºÅÛÀ» ÀÌ¿ëÇÏ¿© ¾òÀº ½ÇÁ¦ ½ÇÇè °á°ú °£ÀÇ »ó°ü°ü°è°¡ ³ô¾Ò±â ¶§¹®¿¡, ½ÇÇè °á°ú°¡ ½ÇÇè µðÀÚÀÎÀ» Àß ¹Ý¿µÇÏ´Â °ÍÀ» È®ÀÎÇÒ ¼ö ÀÖ¾ú´Ù.



±×¸² 3. ¹«ÀÛÀ§ÀûÀ¸·Î ¼±Á¤µÈ ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§(A) ¶Ç´Â ÇÕ¸®ÀûÀ¸·Î ¼±Á¤µÈ ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§(B)¿Í ÇÁ·Î¸ðÅÍ Á¶ÇÕ ÀÛµ¿ È®ÀÎ


¶ÇÇÑ ±âÁ¸¿¡ ¿©·¯ ¹æ¼±±Õ Á¾¿¡¼­ »ç¿ëµÇ´Â ÇÁ·Î¸ðÅÍ¿Í º» ¿¬±¸¿¡¼­ ¼±Á¤ÇÑ °­·ÂÇÑ ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§¸¦ Á¶ÇÕÇßÀ» ¶§ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö ¼öÁØÀÌ 4¹è¿¡¼­ 11¹è±îÁö Áõ°¡ÇÏ´Â °ÍÀ» È®ÀÎÇÔÀ¸·Î½á, S. coelicolor »Ó¸¸ ¾Æ´Ï¶ó ´Ù¸¥ ¹æ¼±±Õ¿¡¼­µµ ÀÌ ½Ã½ºÅÛÀ» Àû¿ëÇÒ ¼ö ÀÖ´Â °¡´É¼ºÀ» Á¦½ÃÇÏ¿´´Ù.


±×¸² 4. ±âÁ¸¿¡ ¹æ¼±±Õ¿¡¼­ »ç¿ëµÇ´Â ÇÁ·Î¸ðÅÍ¿Í ÇÕ¸®ÀûÀ¸·Î ¼±Á¤µÈ ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§ Á¶ÇÕ ÀÛµ¿ È®ÀÎ


¼±Á¤ÇÑ ÇÁ·Î¸ðÅÍ/¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§ Á¶ÇÕÀ» Ç×»ýÁ¦ »ýÇÕ¼º Á¶Àý À¯ÀüÀÚ actII-orf4¿¡ Àû¿ëÇÑ °á°ú, ¿¹»óÇÑ ´ë·Î °­·ÂÇÑ ÇÁ·Î¸ðÅÍ¿Í °­·ÂÇÑ ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§ Á¶ÇÕÀÌ »ç¿ëµÈ ±ÕÁÖ¿¡¼­ Ç×»ýÁ¦ »ý»êÀÌ 2.6¹è Áõ°¡ÇÑ °ÍÀ» È®ÀÎÇÏ¿´´Ù. ¶ÇÇÑ ÀûÁ¤·®ÀÌ ¹ßÇöµÉ ¶§ Ç×»ýÁ¦ »ý»êÀ» Áõ°¡½ÃŲ´Ù°í ¾Ë·ÁÁø metK À¯ÀüÀÚ¿¡ °°Àº ½Ã½ºÅÛÀ» Àû¿ëÇßÀ» ¶§, ¿ÀÈ÷·Á ¾àÇÑ ÇÁ·Î¸ðÅÍ¿Í ¾àÇÑ ¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§ Á¶ÇÕ¿¡¼­ °¡Àå ¸¹Àº Ç×»ýÁ¦°¡ »ý»êµÇ¾î¼­ ±âÁ¸ÀÇ Á¤º¸¿Í ½ÇÇè °á°ú°¡ ÀÏÄ¡ÇÏ´Â °ÍÀ» È®ÀÎÇÏ¿´°í, ÀÌ °á°ú´Â º» ¿¬±¸¿¡¼­ °³¹ßÇÑ ´Ù¾çÇÑ ÇÁ·Î¸ðÅÍ/¸®º¸¼Ø°áÇÕºÎÀ§ Á¶ÇÕÀÌ Å¸°Ù À¯ÀüÀÚ¸¦ ƯÁ¤ ¼öÁØÀ¸·Î ¹ßÇö½Ãų ¶§ À¯¿ëÇÏ°Ô »ç¿ëµÉ ¼ö ÀÖÀ½À» º¸¿©ÁØ´Ù.


±×¸² 5. Ç×»ýÁ¦ »ýÇÕ¼º À¯ÀüÀÚ actII-orf4 Á¶ÀÛ ±ÕÁÖÀÇ »ýÀå°î¼±(A)°ú Ç×»ýÁ¦ »ý»ê·®(B),

ActII-orf4 Á¶Àý À¯ÀüÀÚ metK Á¶ÀÛ ±ÕÁÖÀÇ »ýÀå°î¼±(C)°ú Ç×»ýÁ¦ »ý»ê·®(D)


3. ±â´ëÈ¿°ú


º» ¿¬±¸¿¡¼­ °³¹ßÇÑ ¹ßÇö ½Ã½ºÅÛÀº ¿£Áö´Ï¾î¸µ ½Ã À¯¿ëÇÑ µµ±¸¸¦ Á¦°øÇÔÀ¸·Î½á À¯ÀüÀû µðÀÚÀΰú ½ÇÇèÀû ±¸Çö »çÀÌÀÇ °¸À» ÁÙÀÏ °ÍÀ¸·Î ±â´ëµÈ´Ù. ¶ÇÇÑ º» ¿¬±¸´Â Àü»çü Á¤º¸¿¡ ÀÇÁ¸ÇÏ´ø ±âÁ¸ÀÇ ÇÁ·Î¸ðÅÍ °Ë»ö ¹æ¹ýÀ» ¿©·¯ ¼öÁØÀÇ Â÷¼¼´ë ¿°±â¼­¿­ºÐ¼® Á¤º¸¸¦ ÀÌ¿ëÇÑ ÇÕ¸®ÀûÀÎ µðÀÚÀÎ ¹æ¹ýÀ¸·Î ¹ßÀü½ÃÄ×°í, ÀÌ´Â ´Ù¸¥ Á¾¿¡¼­ ´Ù¾çÇÑ ´Ü¹éÁú ¹ßÇö ½Ã½ºÅÛ ±¸ÃàÀ» À§ÇÑ À¯ÀüÀÚ Á¶ÀÛ µðÀÚÀÎ ½Ã ÅëÂû·ÂÀ» Á¦°øÇÒ °ÍÀÌ´Ù.


Âü°í¹®Çå
Jeong Y, Kim JN, Kim MW, Bucca G, Cho S, Yoon YJ, Kim BG, Roe JH, Kim SC, Smith CP, Cho BK (2016). The dynamic transcriptional and translational landscape of the model antibiotic producer Streptomyces coelicolor A3(2). Nat Commun. 2016 Jun 2;7:11605.








Total:45 page:(3/2)
29 Á¤º¸ ISBC »ý¹° ģȭÀûÀÎ Fe2O3 ¿äÅ©½© ÀÔÀÚÀÇ ´ë±Ô¸ð ¿¡¾î.. 18.09.04 3508
28 Á¤º¸ ISBC Ç×»ýÁ¦ »ý»ê ÃÖÀûÈ­¸¦ À§ÇÑ ¹æ¼±±Õ À¯ÀüÀû µµ±¸ .. 18.09.04 2951
27 Á¤º¸ ISBC Àúºñ¿ë °íÈ¿À² ¸ÂÃãÇü ¹Ì»ý¹° °Ë»ö Ç÷§Æû °³¹ß 18.09.04 5887
26 Á¤º¸ ISBC ÄÚ¸®³×¹ÚÅ׸®¿ò ±Û·çŸ¹ÌÄñ¿¡¼­ Çì¹Ì¼¿·ê·Î¿À½º .. 18.09.04 4265
25 Á¤º¸ ISBC Ç×»ýÁ¦ »ýÇÕ¼º ¹æ¼±±Õ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö Á¶Àý ±Ô¸í 18.09.04 3272
24 Á¤º¸ ISBC NK cell¿¡¼­ NF-¥êBÀÇ ´Ü°èÀû ÀλêÈ­¿Í Á¶ÀýÀ» Åë.. 18.09.04 4024
23 Á¤º¸ ISBC Cross linker¸¦ ÅëÇØ ¾ÈÁ¤È­µÇ´Â À¶ÇÕ ¾ËÆÄÇ︯½º.. 18.09.04 4490
22 Á¤º¸ ISBC Àü»çü ºÐ¼®°ú DNA-free CRISPR ½Ã½ºÅÛÀ» ÀÌ¿ëÇÑ .. 18.09.04 4766
21 Á¤º¸ ISBC Antisense RNA ±â¹Ý Á¤Á·¼öÀÎ½Ä Â÷´ÜÈ¿¼Ò °í¼Ó´Ù.. 18.08.30 3990
20 Á¤º¸ ISBC À¯ÀüÀÚ ¹ßÇö ÆÐÅÏÀ» ÀÌ¿ëÇÑ ¾à¹°Ç¥ÀûÀûÇÕ¼ºÀÇ °³.. 18.08.30 4094
19 Á¤º¸ ISBC ´ç °¨Áö °í°¨µµ FRET ´Ü¹éÁú ¼¾¼­ ¹× ¼ÒÇü °¨Áö .. 18.08.30 5008
18 Á¤º¸ ISBC ´ëÀå±Õ ÃÑÀ¯Àüü³»ÀÇ ArgR Àü»çÀÎÀÚ¿Í DNA °áÇÕü.. 18.08.30 3621
17 Á¤º¸ ISBC Á¾¾ç Ç÷°üÀÇ ½Å»ý°ú ÁøÇàÀ» È¿À²ÀûÀ¸·Î ¾ïÁ¦ÇÏ´Â .. 18.08.30 4098
16 Á¤º¸ ISBC Æ÷À¯¼¼Æ÷¿¡¼­ CRISPR Àü»ç ¾ïÁ¦ ÀåÄ¡¿Í À¯ÀüÀÚ È¸.. 18.08.30 3215
15 Á¤º¸ ISBC ¾ËÄÚ¿Ã ºÐÇØÈ¿¼Ò III (Alcohol Dehydrogenase III.. 18.08.30 3804
14 Á¤º¸ ISBC FACS ±â¹ÝÀÇ ÇÕ¼º Àΰ£ Ç×ü Ãʰí¼Ó ¹ß±¼ ½Ã½ºÅÛ .. 18.08.30 4565
[1] [2] [3]